个人简介:
陈耕博士,中山大学医学院副教授,博士研究生导师。长期从事G蛋白偶联受体(GPCRs)结构动态研究,下游信号转导途径以及相关的药物开发工作。近五年已发表高水平论文十余篇,包括以第一作者和通讯作者在Cell Research,Nature Communications, Science Advances , PNAS和Cell Reports等高水平国际学术期刊发表的研究成果。获得包括国家自然科学基金青年科学基金项目在内的多项基金资助。
研究领域:
G蛋白偶联受体(GPCR)家族是人体最重要的信号传导分子,参与体内80%以上的生理功能调控,是约34%临床药物的作用靶点。作为七次跨膜蛋白的典型代表,GPCR不仅为膜蛋白结构和动态构象研究提供了范式,更为新药研发提供了关键靶标,其相关研究曾获诺贝尔化学奖,至今仍是结构生物学、药物开发和精准医疗的核心研究方向。
本课题组采用多学科融合的交叉研究体系,聚焦GPCR的动态结构与功能调控机制研究。整合冷冻电镜技术、单分子荧光分析和氢氘交换质谱等先进生物物理手段,结合生物化学、药理学和计算生物学研究方法,系统阐明GPCR复杂的动态构象调控和被药物或内源配体激活的分子机制。
同时,以解析的蛋白复合体结构为基础,整合人工智能辅助的小分子药物从头生成和设计、虚拟筛选及DNA编码化合物库高通量筛选等前沿技术,系统开展先导化合物的发现与优化研究。通过理性药物设计策略,对获得的苗头化合物进行结构优化和药效学验证,开发具有全新作用机制的小分子药物候选物。
招生专业:博士/硕士 071010生物化学与分子生物学, 086000生物与医药
招聘信息:本课题组目前招收博士研究生(2026年入学)、博士后和科研助理,可提供良好的科研环境和资源,以及专业的结构生物学相关技能培训,欢迎加入!
教育及工作经历
2025.08 – 至今: 副教授,中山大学医学院
2018.09 – 2025.08: 博士后研究员/研究助理教授,科比尔卡创新药物开发研究院,医学院,香港中文大学(深圳)
2014.06 – 2018.06: 博士后研究员,佐治亚州立大学(美国)
2012.08 – 2014.06: 博士后研究员,得克萨斯大学奥斯汀分校(美国)
2008.08 – 2012.08: 生物学博士,贝勒大学(美国)
2004.09 – 2008.07: 生命科学学士,中国农业大学
主持科研项目:
(1)国家自然科学基金青年科学基金项目, 2024年1月至2026年12月。
(2)广东省基础和应用基础研究基金项目, 2020年10月 至 2023年9月。
(3)深圳市基础研究面上项目,2022年10月至2025年10月。
代表性成果(第一作者#,通讯作者*)
1. Zhangsong Wu; Chen Qiu; Yiming Liu; Xiaoyi Yan; Qiaohui Li; Shirui Jiang; Jun Xu; Xin Pan; Fang Ye; Zhiyi Zhang; Peiruo Ning; Binghao Zhang; Lezhi Xu; Bangning Cheng; Xufu Xiang; Chungen Qian*; Yang Du*; Geng Chen*. "Structural Insights into Prolactin-Releasing Peptide Receptor Signaling and G Protein Coupling Selectivity." Cell Reports, 2025,44 (3).
2. Shuai Fang#, Li Zhou#, Geng Chen#, Jing Zhang, Xiaoyu Wang, In Ho Jeong, Savannah E. Jacobs, Bradley R. Kossmann, Wei Wei, Shu Liu, Geon H. Jeong, Yayun Xie, Duc Duong, Nicholas T. Seyfried, Ivaylo Ivanov, Angela M. Mabb, Hiroaki Kiyokawa, Bo Zhao, Jun Yin. "Engineering a Cell-Based Orthogonal Ubiquitin Transfer Cascade for Profiling the Substrates of RBR E3 Parkin." iScience (2025).
3. Zhangsong Wu#; Geng Chen#*; Chen Qiu#; Xiaoyi Yan; Lezhi Xu; Shirui Jiang; Jun Xu; Runyuan Han; Tingyi Shi; Yiming Liu; Wei Gao; Qian Wang; Jiancheng Li; Fang Ye; Xin Pan; Zhiyi Zhang; Peiruo Ning; Binghao Zhang; Jing Chen*; Yang Du*. "Structural basis for the ligand recognition and G protein subtype selectivity of kisspeptin receptor." Science Advances, 2024, 10 (33): eadn7771.
4. Fang Ye; Xin Pan; Zhiyi Zhang; Xufu Xiang; Xinyu Li; Binghao Zhang; Peiruo Ning; Aijun Liu; Qinggong Wang; Kaizheng Gong; Jiancheng Li; Lizhe Zhu; Chungen Qian*; Geng Chen*; Yang Du*. "Structural basis for ligand recognition of the human hydroxycarboxylic acid receptor HCAR3." Cell Reports, 2024, 43(11).
5. Geng Chen; Nico Staffen; Zhangsong Wu; Xinyu Xu; Jinheng Pan; Asuka Inoue; Tingyi Shi; Peter Gmeiner; Yang Du; Jun Xu. "Structural and functional characterization of the endogenous agonist for orphan receptor GPR3." Cell Research, 2024, 1-4.
6. Jun Xu#; Geng Chen#; Haoqing Wang; Sheng Cao; Jie Heng; Xavier Deupi; Yang Du; Brian K Kobilka. "Calcineurin-fusion facilitates cryo-EM structure determination of a Family A GPCR.” Proceedings of the National Academy of Sciences (PNAS), 2024, 121(48): e2414544121.
7. Aijun Liu#; Yezhou Liu#; Geng Chen#; Wenping Lyu#; Junlin Wang; Qiwen Liao; Fang Ye; Lizhe Zhu; Yang Du; Richard D. Ye. "Cryo-EM structure of the human G-protein coupled receptor 1 (GPR1)–Gi protein complex bound to the chemerin C-terminal nonapeptide." Plos biology, 2024, 22(10): e3002838.
8. Junlin Wang#; Geng Chen#; Qiwen Liao#; Wenping Lyu; Aijun Liu; Lizhe Zhu; Yang Du; Richard D Ye. "Cryo-EM structure of the human chemerin receptor 1–Gi protein complex bound to the C-terminal nonapeptide of chemerin." Proceedings of the National Academy of Sciences (PNAS), 2023, 120(11): e2214324120.
9. Thian‐Sze Wong#; Wei Gao#; Geng Chen#; Chen Qiu#; Guodong He; Fang Ye; Zhangsong Wu; Zicheng Zeng; Yang Du. "Cryo‐EM structure of orphan G protein‐coupled receptor GPR21. " MedComm, 2023, 4(1): e205.
10. Fang Ye#; Thian‐Sze Wong#; Geng Chen#; Zhiyi Zhang; Binghao Zhang; Shiyi Gan; Wei Gao; Jiancheng Li; Zhangsong Wu; Xin Pan; Yang Du. "Cryo‐EM structure of G‐protein‐coupled receptor GPR17 in complex with inhibitory G protein. " MedComm, 2023, 3(4): e159.
11. Geng Chen; Xiankun Wang; Qiwen Liao; Yunjun Ge; Haizhan Jiao; Qiang Chen; Yezhou Liu; Wenping Lyu; Lizhe Zhu; Gydo CP van Zundert; Michael J Robertson; Georgios Skiniotis; Yang Du; Hongli Hu; Richard D Ye. "Structural basis for recognition of N-formyl peptides as pathogen-associated molecular patterns.” Nature Communications, 2022, 13(1): 5232.
12. Geng Chen; Jun Xu; Asuka Inoue; Maximilian F Schmidt; Chen Bai; Qiuyuan Lu; Peter Gmeiner; Zheng Liu; Yang Du. "Activation and allosteric regulation of the orphan GPR88-Gi1 signaling complex." Nature Communications, 2022, 13(1): 2375.
13. Yiyang Wang#; Shuai Fang#; Geng Chen#; Rakhee Ganti; Tatiana A Chernova; Li Zhou; Duc Duong; Hiroaki Kiyokawa; Ming Li; Bo Zhao; Natalia Shcherbik; Yury O Chernoff; Jun Yin. "Regulation of the endocytosis and prion-chaperoning machineries by yeast E3 ubiquitin ligase Rsp5 as revealed by orthogonal ubiquitin transfer. " Cell Chemical Biology, 2021, 28(9): 1283-1297.e8.
14. Geng Chen; Xiankun Wang; Yunjun Ge; Ling Ma; Qiang Chen; Huihui Liu; Yang Du; Richard D Ye; Hongli Hu; Ruobing Ren. "Cryo-EM structure of activated bile acids receptor TGR5 in complex with stimulatory G protein." Signal Transduction and Targeted Therapy, 2020, 5(1): 142.