个人简介
刘斯洋,生物信息学博士,中山大学中山医学院副教授、研究员、博士研究生导师, 中山大学逸仙优秀学者。入选国家自然科学基金青年科学基金项目(B类)、广东省重大人才工程青年项目和深圳市海外高层次人才等人才计划。长期面向妇幼重大疾病病因解析与精准防治的临床需求,开展妇幼健康医疗场景下统计遗传学、生物信息学与人工智能方法的研发及应用研究。相关成果发表SCI论文60余篇,其中以第一作者或通讯作者(含共同)在《Cell》《Nature》《Nature Genetics》《Blood》《Journal of Hepatology》等国际高水平期刊发表论文30余篇;获授权发明专利7项;主持国家级、省部级及地方科研项目8项。
课题组公众号
LiuLab遗传统计与生物信息
研究方向
大数据与AI驱动的疾病防控体系及精准诊疗策略研究
工作经历
2026/07-至今 中山大学中山医学院 副教授,博导
2026/05-2026/07 中山大学生物安全学院 副教授,博导
2021/01-2026/05 中山大学公共卫生学院(深圳)副教授,博导
2020/01-2020/12 深圳华大生命科学研究院 研究员(正高),博导
2018/01-2019/12 深圳华大生命科学研究院 信息研发高级工程师
教育经历
2015/05-2017/12 丹麦哥本哈根大学,生物信息学博士,导师:Anders Krogh & Anders Albrechtsen
2012/09-2015/04 丹麦哥本哈根大学,生物信息学硕士,导师:Anders Krogh
2007/09-2011/06 中山大学, 生命科学学院,理学学士
讲授课程
课程负责人: 《R语言与统计分析》《医学信息学编程》
参与课程: 《人工智能导论》《医学统计学》《Python与数据科学》
《生物信息学》《公共卫生与人工智能》
教学改革
中国政府奖学金与广东省研究生教育创新计划项目- 健康医疗大数据与智能统计国际暑期学校国际暑期学校 (https://phssummercamp.com/)
承担课题及科研项目
主持:
1. 国家自然科学基金青年科学基金项目(B类)[原优秀青年科学基金项目], 基于健康医疗大数据的母婴疾病病因解析方法研发与应用,2026.01-2028.12, 主持,在研
2. 国家自然科学基金面上项目, 探究健康与疾病起源的生命历程孟德尔随机方法研发与应用,2025.01-2028.12, 主持,在研
3. 国家自然科学基金青年项目,基于低深度测序数据的全基因组关联研究,2020.01-2022.12,主持,结题
4. 广东省重大人才工程青年项目, 2025.09-2028.09, 健康医疗大数据方法研发与应用, 主持,在研
5. 深圳市稳定支持面上项目, 2022.09-2025.08, 主持,基于跨代孟德尔随机化策略解析妊娠期宫内环境暴露对儿童生长发育的因果影响,结题
6. 中山大学“3510”医学创新领航计划临床基础研究专项-重点项目,2026.01-2030.12,在研
7. 中山大学“百人计划”启动项目,2021.01-2023.12, 主持,结题
8. Innovation Fund Denmark, 2015.04-2018.04, 主持,结题
参与:
1. 国家重点研发计划项目, 2022.12-2025.12, 课题骨干,结题
2. 国家重点研发计划项目, 2021.12-2024.11, 课题骨干,结题
3. 广东省基础与应用基础研究区域联合基金-重点项目,2022.01-2025.09, 课题负责人,结题
代表性文章
详见https://liusylab.org/publication/
时间倒序 (#共同第一作者; *共同通讯作者; IF五年影响因子)
1. Liu S#*, Zheng H#, Gu Y#, Yang Z#, Zhen J#, Wei Y, Liu Y, Chen Y, Wan Z, Guo X, Hu L, Chen X, Li X, Qiu X, Huang S, Chen GB, Hu Z, Namba S, Kanai M, Matsuda K, Okada Y*, Zhang Q*, Wei F*. Genome-wide association analyses of gestational phenotypes identify context-specific genetic effects. Nature Genetics. 2026 【共一共通讯,IF=35.3/JCR Q1/中科院一区】(Website: https://monn.pheweb.com/)
2. Li Y#, Lin YF#, Cai B, Chen F, Zhang Q, Liu S*, Zhen J*. Modelling the epidemic dynamics of HPV among women in China and optimization of ongoing cervical cancer elimination strategies. BMC Medicine. 2026 【共同通讯,IF=9.1/JCR Q1/中科院一区】
3. Cheng S#, Wei Y#, Zheng H, Zhang Q, Yang X, Lu Z, Huang Z, Wan Z, Shi Y, Zhang J, Choi JC, Kang CH, Kim HJ, Kim JG, Bae HJ, Lee J, Lee JY, Jung H, Guo C, Liao X, Wu J, Meng X, Li Z, Debette S, Li H, Wang Y, Cheng S*, Liu S*. Artificial intelligence-powered delta-NIHSS-based model for predicting recurrence, disability and mortality after acute ischaemic strokes (DISCO): a modelling study. eClinicalMedicine. 2025 【最后通讯,IF=10.0/JCR Q1/中科院一区】(Website: https://www.discosysu.cn/)
4. Gu Y#, Zheng H#, Wang P#, Liu Y, Guo X, Wei Y, Yang Z, Cheng S, Chen Y, Hu L, Chen X, Zhang Q, Chen G, Wei F*, Zhen J*, Liu S*. Genetic architecture and risk prediction of gestational diabetes mellitus in Chinese pregnancies. Nature Communications. 2025 【最后通讯,IF=17.3/JCR Q1/中科院一区】
5. Liu Y#, Wei Y#, Chen X#, Huang S#, Gu Y, Yang Z, Guo X, Zheng H, Feng H, Huang M, Chen S, Xiao T, Hu L, Zhang Q, Zhang Y, Chen G, Qiu X*, Wei F*, Zhen J*, Liu S*. Genetic study of intrahepatic cholestasis of pregnancy in Chinese women unveils East Asian etiology linked to historic HBV epidemic. Journal of Hepatology. 2025 (封面论文) 【最后通讯,IF=28.1/JCR Q1/中科院一区】
6. Yang Z#, Hu L#, Zhen J#, Gu Y, Liu Y, Huang S, Wei Y, Zheng H, Guo X, Chen G, Yang Y, Xiong L*, Wei F*, Liu S*. Genetic Basis of Altered Platelet Counts and Gestational Thrombocytopenia in Pregnancy. Blood. 2024 【最后通讯,IF=19.7/JCR Q1/中科院一区】
7. Wei Y#, Zhen J#, Hu L#, Gu Y, Liu Y, Guo X, Yang Z, Zheng H, Cheng S, Wei F*, Xiong L*, Liu S*. Genome-wide association studies of thyroid-related hormones, dysfunction, and autoimmunity among 85,421 Chinese pregnancies. Nature Communications. 2024 【最后通讯,IF=17.3/JCR Q1/中科院一区】
8. Huang S#, Liu S#, Huang M#, He J#, Wang C, Wang T, Feng X, Kuang Y, Lu J, Gu Y, Xia X, Lin S, BIGCS Group, Zhou W, Fu Q, Xia H*, Qiu X*. The Born in Guangzhou Cohort Study enables generational genetic discoveries. Nature. 2024 【共一第二,IF=55.0/JCR Q1/中科院一区】
9. Liu S#*, Liu Y, Gu Y, Lin X, Zhu H, Liu H, Xu Z, Cheng S, Lan X, Huang M, Li H, Nielsen R, Davies R, Albrechtsen A, Chen G, Qiu X, Jin X*, Huang S*. Utilizing non-invasive prenatal test sequencing data for human genetic investigation. Cell Genomics. 2024 (封面论文) 【唯一第一兼共同通讯,IF=9.3/JCR Q1/中科院一区】
10. Liu S#*, Yao J#, Lin L#, Lan X#, Wu L#, He X#, Kong N, Li Y, Deng Y, Xie J, Zhu H, Wu X, Li Z, Xiong L, Wang Y, Ren J, Qiu X, Zhao W, Gao Y, Chen Y, Su F, Zhou Y, Rao W, Zhang J, Hou G, Huang L, Li L, Liu X, Nie C, Luo L, Zhao M, Liu Z, Chen F, Lin S, Zhao L, Fu Q, Jiang D, Yin Y, Xu X, Wang J, Yang H, Wang R, Niu J*, Wei F*, Jin X*, Liu S*. Genome-wide association study of maternal plasma metabolites during pregnancy. Cell Genomics. 2024 【共一共通讯,IF=9.3/JCR Q1/中科院一区】
11. Zhen J#, Gu Y#, Wang P, Wang W, Bian S, Huang S, Liang H, Huang M, Yu Y, Chen Q, Jiang G, Qiu X, Xiong L*, Liu S*. Genome-wide association and Mendelian randomisation analysis among 30,699 Chinese pregnant women identifies novel genetic and molecular risk factors for gestational diabetes and glycaemic traits. Diabetologia. 2024 【最后通讯,IF=9.8/JCR Q1/中科院一区】
12. Bian S#, Guo X#, Yang X, Wei Y, Yang Z, Cheng S, Yan J, Chen Y, Chen G, Du X, Francis S, Shu Y*, Liu S*. Genetic determinants of IgG antibody response to COVID-19 vaccination. The American Journal of Human Genetics. 2024 【最后通讯,IF=9.7/JCR Q1/中科院一区】
13. Cheng S, Zheng H, Wei Y, Lin X, Gu Y, Guo X, Fan Z, Li H, Cheng S*, Liu S*. Gut Microbiome and Stroke: a Bidirectional Mendelian Randomisation Study in East Asian and European Populations. Stroke and Vascular Neurology. 2024 【最后通讯,IF=5.9/JCR Q1/中科院二区】
14. Cheng S#, Xu Z#, Bian S, Chen X, Shi Y, Li Y, Duan Y, Liu Y, Lin J, Jiang Y, Jing J, Li Z, Wang Y, Meng X, Liu Y, Fang M, Jin X, Xu X, Wang J, Wang C, Li H, Liu S*, Wang Y*. The STROMICS genome study: deep whole genome sequencing and analysis of 10K Chinese patients with ischemic stroke reveal complex. Cell Discovery. 2023 【共同通讯,IF=14.3/JCR Q1/中科院一区】
15. Liu S#, Huang S#, Chen F#, Zhao L#, Yuan Y#, Francis S, Fang L, Li Z, Lin L, Liu R, Zhang Y, Xu H, Li S, Zhou Y, Liu Q, Walters R, Lin K, Ju J, Korneliussen T, Yang M, Fu Q, Wang J, Zhou L, Krogh A, Zhang H, Wang W, Chen Z, Yin Y, Yang H, Mao M, Shendure J, Wang J*, Albrechtsen A*, Jin X*, Nielsen R*, Xu X*. Genomic Analyses from Non-invasive Prenatal Testing Reveal Genetic Associations, Patterns of Viral Infections, and Chinese Population History. Cell. 2018 【共一第一,IF=48.8/JCR Q1/中科院一区】
专利情况
1. Base mutation detection method and apparatus based on sequencing data, and storage medium, 2023, PCT/CN2019/086972 (中国、欧洲、沙特、马来西亚四国授权)
2. 一种基于基因组组装的变异检测方法和装置, 2015,ZL201510043793.2 (中国授权)
3. 一种卒中预后预测方法、系统、计算机设备及存储介质, 2024119535280 (中国授权)
4. 妊娠糖尿病风险预测方法、装置、介质及产品,2025101592122
会议特邀学术报告 (近5年, 时间倒序)
1. Siyang Liu, East Asian ‘intrahepatic cholestasis of pregnancy’ may be linked to a historic HBV epidemic, XXVIII International Bile Acid Meeting - BILE ACIDS IN HEALTH AND DISEASE 2026, Vienna, Austria, Jul 3rd, 2026
2. 刘斯洋,中国人群百余种妊娠期表型动态遗传图谱的构建与解析,中国预防科学血学会儿少分会公共卫生前沿交叉论坛,南京,中国,2026年5月
3. 刘斯洋,跨代孟德尔随机化探讨母体蛋白代谢组宫内环境特征对子代孤独症的潜在因果影响,中国环境诱变剂学会环境与妇幼健康专业委员会首届学术研讨会,南京,中国,2026年5月
4. 刘斯洋,母婴疾病病因解析方法研发与应用,第三届全国基因组信息学大会,杭州,中国,2026年3月
5. 刘斯洋,基于健康医疗大数据解析母婴疾病与表型的遗传基础和环境成因, 中国功能基因组与系统生物学分会2025全国学术研讨会,长沙,中国,2025年4月
6. Siyang Liu, Utilizing non-invasive prenatal test sequencing data for medical genetic investigation, 中国遗传学会2024全国学术研讨会, 长沙,中国, 2024年11月
7. Shiyao Cheng & Siyang Liu, Developing and Validating DISCO: An Accurate and Explainable Machine Learning Model for Predicting Composite Post-Stroke Outcomes, The 31st Workshop of the International Stroke Genomic Consortium, Los Angeles, US, Sep 26th 2024
8. Siyang Liu, STROMICS: Methodologies and advancements in multi-omics research of stroke, The 10th Annual Conference of the Chinese Stroke Association & Tiantan International Stroke Conference, Beijing, China, Jun 14th 2024
9. Siyang Liu, An atlas of quantitative trait loci for a hundred gestational phenotypes, The 57th European Human Genetic Conference, Berlin, Germany, Jun 3rd 2024
10. Siyang Liu, Mendelian randomization of inflammation on stroke recurrence, The 30th Workshop of the International Stroke Genetics Consortium, Munich, Germany, Apr 24th 2024
11. Siyang Liu, Multi-trait genome-wide association study in 34,394 Chinese women reveals the genetic architecture of plasma metabolites during pregnancy, The International conference of bioinformatics and computation biology, Hangzhou, China, Apr 22nd 2023
获奖与荣誉
2026 中山大学优秀本科毕业论文指导老师
2025 中山大学优秀博士研究生毕业论文指导老师
2024 主持《R语言与统计分析》获评深圳市高等院校“精品共享课”
2024 中山大学优秀硕士研究生毕业论文指导老师
2023-2024 全国大学生统计建模大赛国家级奖项、广东省一等奖指导老师
2022 中山大学优秀本科毕业论文指导老师
2018 深圳市海外高层次人才-孔雀B
2018 深圳华大生命科学研究院 重大科研成果奖
2012-2014 Danish Government Scholarship
2007-2010国家奖学金
学术兼职
1. 生殖医学与子代健康全国重点实验室,核心成员
2. 教育部-上海市环境与儿童健康重点实验室,核心成员
3. 中国环境诱变剂学会环境与妇幼健康专业委员会,常务委员
4. 中国卒中学会多组学分会,常务委员
5. 中国系统工程学会数字医疗健康系统工程专委会,委员
6. 广东省营养转化工程技术研究中心,核心成员
7. 深圳市病原微生物与生物安全重点实验室,核心成员
学生培养
详见https://liusylab.org/people/
招生信息
一般招收博士生1人/年(招生专业: 生物信息学)、硕士生2人/年(招生专业: 生物信息学、生物与医药),本科生2-3人/年进行科研训练,常年招收博士后以及专职科研人员(助理研究员及研究助理)。热忱欢迎对统计遗传学、生物信息学以及医学人工智能等领域感兴趣的的同仁加入研究团队!
联系人:刘斯洋,联系方式:liusy99@mail.sysu.edu.cn ,来信请注明申请方向及职位。


